Alan hat Alice aus dem Dunkel erlöst. Deshalb ist sie aufgetaucht. Im Gegenzug muss Alan allerdings in der Dunkelheit bleiben. In der weiteren Endsequenz hat man dann ja noch das Deerfest gesehen mit Rose und Agent Nightingale. Letzterer wurde ja eigentlich in der Polizeistation von der Dunkelheit verschlungen/angegriffen. Weshalb er entweder die Dunkelheit selbst ist, was sein erneutes Auftreten erklärt, oder er ist auch in der Dunkelheit gefangen und dies ist sein Doppelgänger. So erklärte es zumindest Thomas Zane im Laufe des Spiels. ...Ist man in der Dunkelheit gefangen, dann begegnen die Personen einem Doppelgänger; einer leeren Hülle.
Auch Rose, die Kellnerin, scheint noch weiterhin von der Dunkelheit bessessen zu sein, wie man im Abspann sieht.
Das meint Alan auch mit der Aussage es sei kein See, sondern ein ganzer Ozean: Die Gefahr ist größer und reicht tiefer als man meint!
Mit dem "wake up" am Ende wollen sich die Entwickler vermutlich einfach nur ein Hintertürchen für den Nachfolger offen halten, oder auf den Anfang des Spiels eingehen.
Vllt. war alles erlebte doch nur ein Traum und das einzig Wahre war die Sequenz im "Irrenhaus" und am Ende möchte jemand Alan wecken und er nimmt es mit Alice' Stimme wahr.
Darauf zumindest lässt auch die letzte spielbare Sequenz (dort, wo alles in Dunkel getaucht ist und man mit der Taschenlampe die einzelnen Gegenstände "freileuchtet" ) schliessen. Alan und Alice haben eine Beziehung, doch Alan kümmert sich zu wenig um Alice und hat aufgrund seiner Arbeiten kaum Zeit für sie. Alice will ihn daraufhin verlassen und das verkraftet Alan nicht. Er wird somit verrückt und eingewiesen. Vermutlich hat er sie sogar umgebracht. Dr. Hartman sagt ja in der vermeindlich einzig wahren Begebenheit, dass Alice tot sei.
Ich glaub da bleibt viel Platz für eigene Vorstellung und das macht es so reizvoll!
Soweit zum Ende und meiner Interpretation dazu. Mag manch einer komplett anders verstanden haben, aber ich bin ganz zufrieden damit.